{
  "method": "Biopython 1.85 global BLOSUM62, gap open -10, extension -0.5",
  "inputs": [
    {
      "path": "genes/human/DUOX1/DUOX1-uniprot.txt",
      "accession": "Q9NRD9",
      "length": 1551,
      "sequence_sha256": "3746310d41ae0ed1c47e6e0fc00f4fb4977cfd0dad44febbf2397cc980ac7dce"
    },
    {
      "path": "genes/HORSE/DUOX1/DUOX1-uniprot.txt",
      "accession": "A0A9L0SQG9",
      "length": 1452,
      "sequence_sha256": "d23306567ab8463753bbb06a26bbffedc78951457a0c03771bc656eb354a194c"
    }
  ],
  "score": 7027.0,
  "paired_residues": 1452,
  "identical_residues": 1327,
  "identity_among_paired": 0.9139118457300276,
  "coverage_left": 0.9361702127659575,
  "coverage_right": 1.0,
  "alignment": "target            0 MGFCLALAWTLLVGAWTPLGAQNPISWEVQRFDGWYNNLMEHRWGSKGSRLQRLVPASYA\n                  0 |||||||||.||||.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||\nquery             0 MGFCLALAWILLVGPWMPTGAQNPISWEVQRFDGWYNNLMEHRWGSKGSRLQRLVPASYA\n\ntarget           60 DGVYQPLGEPHLPNPRDLSNTISRGPAGLASLRNRTVLGVFFGYHVLSDLVSVETPGCPA\n                 60 ||||||||||||||||.||||..|||||.||.|||||||||||||.||||||||.|||||\nquery            60 DGVYQPLGEPHLPNPRELSNTAMRGPAGQASMRNRTVLGVFFGYHLLSDLVSVERPGCPA\n\ntarget          120 EFLNIRIPPGDPMFDPDQRGDVVLPFQRSRWDPETGRSPSNPRDPANQVTGWLDGSAIYG\n                120 ||||||||||||.|||...||||||||||||||.||.|||||||..|.||||||||||||\nquery           120 EFLNIRIPPGDPVFDPNRSGDVVLPFQRSRWDPKTGQSPSNPRDLTNEVTGWLDGSAIYG\n\ntarget          180 SSHSWSDALRSFSRGQLASGPDPAFPRDSQNPLLMWAAPDPATGQNGPRGLYAFGAERGN\n                180 |||||||.|||||.|||||||||||||||..||.||.||||||||.|..|||||||||||\nquery           180 SSHSWSDELRSFSGGQLASGPDPAFPRDSKDPLFMWTAPDPATGQRGSQGLYAFGAERGN\n\ntarget          240 REPFLQALGLLWFRYHNLWAQRLARQHPDWEDEELFQHARKRVIATYQNIAVYEWLPSFL\n                240 |.||.|||||||||||||.||||||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||\nquery           240 RDPFVQALGLLWFRYHNLCAQRLAREHPSWGDEELFQHARKRVIATYQNIAVYEWLPSFL\n\ntarget          300 QKTLPEYTGYRPFLDPSISSEFVAASEQFLSTMVPPGVYMRNASCHFQGVINRNSSVSRA\n                300 .|.||.|.||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||\nquery           300 RKMLPDYAGYRPFLDPGISPEFLAASEQFFSTMVPPGVYMRNASCHFQGVLNRNSSISRA\n\ntarget          360 LRVCNSYWSREHPSLQSAEDVDALLLGMASQIAEREDHVLVEDVRDFWPGPLKFSRTDHL\n                360 |||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||\nquery           360 LRVCNSYWSREHPNLQRAEDMDALLLGMASQIAEREDNVVVEDVRDFWPGPLKFSRTDHL\n\ntarget          420 ASCLQRGRDLGLPSYTKARAALGLSPITRWQDINPALSRSNDTVLEATAALYNQDLSWLE\n                420 ||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||\nquery           420 ASCLQRGRDLGLPSYTEARAALGLPPITRWQDINPALSRSNGTVLEAIAALYNQDLSRLE\n\ntarget          480 LLPGGLLESHRDPGPLFSTIVLEQFVRLRDGDRYWFENTRNGLFSKKEIEEIRNTTLQDV\n                480 ||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||||||||||..||.|||||.|.||\nquery           480 LLPGGLLESHGDPGPLFSAIVLDQFVRLRDGDRYWFENTRNGLFSEEEIVEIRNTSLRDV\n\ntarget          540 LVAVINIDPSALQPNVFVWHKGDPCPQPRQLSTEGLPACAPSVVRDYFEGSGFGFGVTIG\n                540 ||||.|..|||||||||.||.||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||\nquery           540 LVAVTNMNPSALQPNVFFWHAGDPCPQPRQLSTEGLPACAPPVMRDYFEGSGFGFGVTIG\n\ntarget          600 TLCCFPLVSLLSAWIVARLRMRNFKRLQGQDRQSIVSEKLVGGMEALEWQGHKEPCRPVL\n                600 |||||||||||||||||.||.||||.||||.||||.|||||.|.|||||||.||||..||\nquery           600 TLCCFPLVSLLSAWIVAKLRRRNFKKLQGQGRQSIMSEKLVEGVEALEWQGGKEPCQRVL\n\ntarget          660 VYLQPGQIRVVDGRLTVLRTIQLQPPQKVNFVLSSNRGRRTLLLKIPKEYDLVLLFNLEE\n                660 |.||||||||||.||.|||||||.|||.||..||||||||.|||||||||||||||||||\nquery           660 VHLQPGQIRVVDSRLSVLRTIQLRPPQQVNLILSSNRGRRALLLKIPKEYDLVLLFNLEE\n\ntarget          720 ERQALVENLRGALKESGLSIQEWELREQELMRAAVTREQRRHLLETFFRHLFSQVLDINQ\n                720 ||||||||||.||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||------\nquery           720 ERQALVENLRAALKESGLSFQEWELREKELMRAAVTREQRSHLLETFFRHLFSQ------\n\ntarget          780 ADAGTLPLDSSQKVREALTCELSRAEFAESLGLKPQDMFVESMFSLADKDGNGYLSFREF\n                780 ------------------------------------------------------------\nquery           774 ------------------------------------------------------------\n\ntarget          840 LDILVVFMKGSPEEKSRLMFRMYDFDGNGLISKDEFIRMLRSFIEISNNCLSKAQLAEVV\n                840 ---------------------------------||||||||||||||||||||.||||||\nquery           774 ---------------------------------DEFIRMLRSFIEISNNCLSKDQLAEVV\n\ntarget          900 ESMFRESGFQDKEELTWEDFHFMLRDHNSELRFTQLCVKGVEVPEVIKDLCRRASYISQD\n                900 |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||.|||||||||.\nquery           801 ESMFRESGFQDKEELTWEDFHFMLRDHDSELRFTQLCVKGVQVPEVIKDFCRRASYISQE\n\ntarget          960 MICPSPRVSARCSRSDIETELTPQRLQCPMDTDPPQEIRRRFGKKVTSFQPLLFTEAHRE\n                960 .||||||||.|..|||.|.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||\nquery           861 KICPSPRVSGRYPRSDVEVELTPQRLQCPMDIDPPQEIRRRFGKKVTSFQPLLFTEAHRE\n\ntarget         1020 KFQRSCLHQTVQQFKRFIENYRRHIGCVAVFYAIAGGLFLERAYYYAFAAHHTGITDTTR\n               1020 |||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||\nquery           921 KFQRSRRHQTVQQFKRFIENYRRHIGCVAVFYAIAGGLFLERAYYYAFAAHHMGITDTTR\n\ntarget         1080 VGIILSRGTAASISFMFSYILLTMCRNLITFLRETFLNRYVPFDAAVDFHRLIASTAIVL\n               1080 ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||\nquery           981 VGIILSRGTAASISFMYSYILLTMCRNLITFLRETFLNRYVPFDAAVDFHRLIASTAIVL\n\ntarget         1140 TVLHSVGHVVNVYLFSISPLSVLSCLFPGLFHDDGSELPQKYYWWFFQTVPGLTGVVLLL\n               1140 |||||.||||||||||||||||||||||||||..|||.||||||||||||||||||||||\nquery          1041 TVLHSAGHVVNVYLFSISPLSVLSCLFPGLFHNNGSEFPQKYYWWFFQTVPGLTGVVLLL\n\ntarget         1200 ILAIMYVFASHHFRRRSFRGFWLTHHLYILLYVLLIIHGSFALIQLPRFHIFFLVPAIIY\n               1200 .||.|||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||\nquery          1101 VLAVMYVFASHHFRRHSFRGFWLTHHLYILLYILLIIHGSFALIQLPRFHIFFLVPALIY\n\ntarget         1260 GGDKLVSLSRKKVEISVVKAELLPSGVTHLRFQRPQGFEYKSGQWVRIACLALGTTEYHP\n               1260 .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||\nquery          1161 VGDKLVSLSRKKVEISVVKAELLPSGVTHLQFQRPQGFEYKSGQWVRIACLALGTTEYHP\n\ntarget         1320 FTLTSAPHEDTLSLHIRAAGPWTTRLREIYSAPTGDRCARYPKLYLDGPFGEGHQEWHKF\n               1320 |||||||||||||||||||||||||||||||..||..|||||||||||||||||||||||\nquery          1221 FTLTSAPHEDTLSLHIRAAGPWTTRLREIYSPLTGNGCARYPKLYLDGPFGEGHQEWHKF\n\ntarget         1380 EVSVLVGGGIGVTPFASILKDLVFKSSVSCQVFCKKIYFIWVTRTQRQFEWLADIIREVE\n               1380 |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||\nquery          1281 EVSVLVGGGIGVTPFASILKDLVFKSSVSSQVFCKKIYFIWVTRTQRQFEWLADIIREVE\n\ntarget         1440 ENDHQDLVSVHIYITQLAEKFDLRTTMLYICERHFQKVLNRSLFTGLRSITHFGRPPFEP\n               1440 |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||\nquery          1341 ENDCQDLVSVHIYITQLAEKFDLRTTMLYICERHFQKVLNRSLFTGLRSITHFGRPPFEP\n\ntarget         1500 FFNSLQEVHPQVRKIGVFSCGPPGMTKNVEKACQLINRQDRTHFSHHYENF 1551\n               1500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1551\nquery          1401 FFNSLQEVHPQVRKIGVFSCGPPGMTKNVEKACQLINRQDRTHFSHHYENF 1452\n",
  "limitations": "Pairwise similarity does not establish reciprocal orthology, full-length gene-model correctness or functional conservation."
}