{
  "method": "Biopython 1.85 global BLOSUM62, gap open -10, extension -0.5",
  "inputs": [
    {
      "path": "genes/human/PPP4R4/PPP4R4-uniprot.txt",
      "accession": "Q6NUP7",
      "length": 873,
      "sequence_sha256": "95f220a7d22f19d458655a868f6037f9c0f311a7150d7c7650f0ac0db0608fd6"
    },
    {
      "path": "genes/HORSE/PPP4R4/PPP4R4-uniprot.txt",
      "accession": "A0A9L0S961",
      "length": 865,
      "sequence_sha256": "fe203a9c5add57d5fe350f9418d8712b766dc45fb265a232f14d690262b506fb"
    }
  ],
  "score": 4164.0,
  "paired_residues": 865,
  "identical_residues": 822,
  "identity_among_paired": 0.9502890173410404,
  "coverage_left": 0.9908361970217641,
  "coverage_right": 1.0,
  "alignment": "target            0 MHPPPPAAAMDFSQNSLFGYMEDLQELTIIERPVRRSLKTPEEIERLTVDEDLSDIERAV\n                  0 ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||\nquery             0 MHPPPPGAAMDFSQNSLFGYMEDLQELTIIERPVRRSLKTPEEIERLTVDEDLSDIERAV\n\ntarget           60 YLLSAGQDVQGTSVIANLPFLMRQNPTETLRRVLPKVREALHVAGVEMQLTAAMSFLTIL\n                 60 ||||||||.||||||||||.||||||.||||||||||||.|||||||||||||.||||.|\nquery            60 YLLSAGQDIQGTSVIANLPCLMRQNPAETLRRVLPKVREVLHVAGVEMQLTAAASFLTVL\n\ntarget          120 QDESVSIHAYTHSFLQVILLHLEHRDTGVSNAWLETLLSVIEVLPKETLRHEILNPLVSK\n                120 |.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||\nquery           120 QEESVSIHTYAHSFLQVILLHLEHRDTGVSNAWLETLLSVIEVLPKETLRHEILNPLVSK\n\ntarget          180 AQLSQTVQSRLVSCKILGKLTNKFDAHTIKREILPLVKSLCQDVEYEVRSCMCRQLENIA\n                180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||\nquery           180 AQLSQTVQSRLVSCKILGKLTNKFDAHTIKREILPLVKSLCQDVEYEVRSCMCRQLENIA\n\ntarget          240 QGIGTELTKSVVLPELIELSRDEGSSVRLAAFETLVNLLDIFDTDDRSQTILPLVKSFCE\n                240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||\nquery           240 QGIGTELTKSVVLPELIELSRDEGSSVRLAAFETLVNLLDIFDTDDRSQTILPLVKSFCE\n\ntarget          300 KSFKADESILISLSFHLGKLCHGLYGIFTPDQHLRFLEFYKKLCTLGLQQENGHNENQIP\n                300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||\nquery           300 KSFKADESILISLSFHLGKLCHGLYGIFTPDQHLRFLEFYKKLCTLGLQQENGHNENQIP\n\ntarget          360 PQILEQEKKYISVRKNCAYNFPAMIVFVDPKNFHMELYSTFFCLCHDPEVPVRYTIAICF\n                360 .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||\nquery           360 TQILEQEKKYISVRKNCAYNFPAMIVFVDPKNFHMELYSTFFCLCHDPEVPVRYTIAICF\n\ntarget          420 YEVSKLLNSGVYLIHKELITLLQDESLEVLDALIDHLPEILELMSTGGESSVQENKLSSL\n                420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||\nquery           420 YEVSKLLNSGVYLIHKELITLLQDESLEVLDALIDHLPEILELMSTGGESSVQENKLLSL\n\ntarget          480 PDLIPALTAAEQRAAASLKWRTHEKLLQKYACLPHVISSDQIYYRFLQRMFTIMMTNNVL\n                480 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||\nquery           480 PDLIPALTAAEQRAAASLKWRTHEKLLQKYACLPHVISSDQIYYRFLQRMFTIMMTNNVL\n\ntarget          540 PVQKAASRTLCIFLRYNRKQEQRHEVIQKLIEQLGQGKSYWNRLRFLDTCEFIIEIFSKS\n                540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||\nquery           540 PVQKAASRTLCIFLRYNRKQEQRHEVIQKLIEQLGQGKSYWNRLRFLDTCECIIEIFSKS\n\ntarget          600 FFCKYFFLPAIELTHDPVANVRMKLCYLLPKVKSTLKIPADKHLLQQLEMCVRKLLCQEK\n                600 |||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||\nquery           600 FFCKYFFLPVIELTHDPVANVRMKLCCLLPKVKSTLKIPADKHLLQQLEMCVRKLLCQEK\n\ntarget          660 DKDVLAIVKRTVLELDRMEMSMDAFQKKFYEKDLLDQEKEREELLLLEMEQLEKEKQQND\n                660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||\nquery           660 DKDVLAIVKRTVLELDRMEMSMDAFQKKFYEKDLLDQEKEREELLLLEMEQLEKEKQQND\n\ntarget          720 GRPMSDKMFEKKRRDTKTPTQSLPKNIPISVPGPSSVTPSTSKEIKKSKLIRSQSFNNQA\n                720 |||||||.|||||||||||.-.|||..|..|.||||.|.|||||||||||||||||||||\nquery           720 GRPMSDKTFEKKRRDTKTPA-ALPKSLPVAVAGPSSGTSSTSKEIKKSKLIRSQSFNNQA\n\ntarget          780 FHAKYGNLEKCASKSSTTGYTTSVSGLGKTSVLSLADDSFRTRNASSVPSSFSPNTPLPS\n                780 ||||||||.||.||||...||.|||--.||||.||.|.|||||||.|||.||||||||||\nquery           779 FHAKYGNLDKCTSKSSAAAYTPSVS--AKTSVISLTDNSFRTRNANSVPASFSPNTPLPS\n\ntarget          840 TSRGTGNSVDPKSSGSKDTQPRKATLKSRKSNP 873\n                840 ||||||||.|.||||-||.||||||.----.|. 873\nquery           837 TSRGTGNSADAKSSG-KDAQPRKATF----LNI 865\n",
  "limitations": "Pairwise similarity does not establish reciprocal orthology, full-length gene-model correctness or functional conservation."
}
