Root organelle red flags

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Rows annotating a root organelle term from synthesis evidence
(IBA, IBD, IC, IEA, IGC, IKR, IRD, ISA, ISM, ISO, ISS, RCA), for the first-pass organelles. Rows that
were already REMOVEd are left out. Root only means the review gives the
gene no sub-compartment of that organelle: these are the strongest
candidates for a bold MODIFY to a membrane, lumen or matrix term.

organelle	synthesis rows	root only	with sub-compartment
mitochondrion (GO:0005739)	1333	355	978
endoplasmic reticulum (GO:0005783)	607	207	400
Golgi apparatus (GO:0005794)	320	128	192
peroxisome (GO:0005777)	149	75	74
lysosome (GO:0005764)	150	50	100

mitochondrion (GO:0005739): root only

gene	evidence	action
ARATH/ABCG36	ISM	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
ARATH/ALAAT1	IEA	ACCEPT
ARATH/ALAAT1	ISM	ACCEPT
ARATH/ASP2	IBA	UNDECIDED
ARATH/FLD	ISM	UNDECIDED
ARATH/FPS1	IEA	ACCEPT
ARATH/GLN2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
ARATH/KDTA	IEA	ACCEPT
ARATH/KDTA	ISM	ACCEPT
ARATH/LPXA	IBA	ACCEPT
ARATH/LPXA	IEA	ACCEPT
ARATH/LPXB	IBA	ACCEPT
ARATH/LPXB	IEA	ACCEPT
ARATH/LPXC1	IBA	ACCEPT
ARATH/LPXC1	IEA	ACCEPT
ARATH/LPXC2	IBA	ACCEPT
ARATH/LPXC2	IEA	ACCEPT
ARATH/LPXC3	IEA	ACCEPT
ARATH/LPXC4	IBA	ACCEPT
ARATH/LPXC4	IEA	ACCEPT
ARATH/LPXC5	IBA	ACCEPT
ARATH/LPXC5	IEA	ACCEPT
ARATH/LPXD1	IBA	ACCEPT
ARATH/LPXD1	IEA	ACCEPT
ARATH/LPXD2	IBA	ACCEPT
ARATH/LPXD2	IEA	ACCEPT
ARATH/LPXK	IEA	ACCEPT
ARATH/MKK5	ISM	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
ARATH/WHY3	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
ARATH/WIN1	IEA	UNDECIDED
CANAL/ACH1	IBA	ACCEPT
CANAL/ACH1	IEA	ACCEPT
CANAL/ACH1	ISA	ACCEPT
CARAX/A0A288DUG2	IEA	ACCEPT
CHICK/GLDC	IBA	ACCEPT
CHICK/GLDC	IEA	ACCEPT
CHICK/GLDC	ISS	ACCEPT
DANRE/agxtb	ISS	ACCEPT
DANRE/asah2	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
DANRE/asah2	ISS	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
DANRE/asah2	ISS	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
DANRE/fen1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
DANRE/gtpbp3	IBA	ACCEPT
DANRE/gtpbp3	IEA	ACCEPT
DANRE/gtpbp3	ISS	ACCEPT
DANRE/ldhd	IBA	ACCEPT
DANRE/ldhd	IEA	ACCEPT
DANRE/ldhd	ISS	ACCEPT
DANRE/tusc2a	IBA	ACCEPT
DANRE/tusc2b	IBA	ACCEPT
DROME/Acat1	IBA	ACCEPT
DROME/Acat1	ISM	ACCEPT
DROME/Ar1	ISS	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
DROME/Arg	ISS	UNDECIDED
DROME/CG18528	IBA	ACCEPT
DROME/CG18528	IEA	ACCEPT
DROME/CG18528	ISS	ACCEPT
DROME/CG4610	IBA	ACCEPT
DROME/CG4610	ISS	ACCEPT
DROME/CG4860	IBA	ACCEPT
DROME/Dci	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
DROME/Ech1	IBA	ACCEPT
DROME/Ech1	ISS	ACCEPT
DROME/Echs1	IBA	ACCEPT
DROME/GatB	IBA	ACCEPT
DROME/GatB	IEA	ACCEPT
DROME/GatB	ISS	ACCEPT
DROME/Gcat	IBA	ACCEPT
DROME/Gcat	ISS	ACCEPT
DROME/Got2	IBA	ACCEPT
DROME/Hsp83	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
DROME/Nmnat	ISS	UNDECIDED
DROME/Tdh	ISS	ACCEPT
DROME/awd__P08879	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
DROME/awd__P08879	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
DROME/park	IEA	ACCEPT
EMENI/maiA	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
HORSE/ALDH7A1	IEA	ACCEPT
HORSE/BCAT2	IEA	ACCEPT
HORSE/MAP2K2	IEA	UNDECIDED
HORSE/MYL10	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
HORSE/MYL10	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
NEUCR/NCU06005	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
NEUCR/acu-8	IBA	ACCEPT
NEUCR/acu-8	IEA	ACCEPT
NEUCR/cia30	IBA	ACCEPT
NEUCR/cia30	IEA	ACCEPT
POPTR/ALARS	IEA	ACCEPT
POPTR/GATC	IBA	ACCEPT
POPTR/GATC	IEA	ACCEPT
POPTR/LIP1	IEA	ACCEPT
RAMVA/MAHS	IEA	ACCEPT
RAMVA/RvY_01767	IEA	ACCEPT
SCHPO/SPAC1093.02	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/car2	IBA	UNDECIDED
SCHPO/cem1	IBA	ACCEPT
SCHPO/cem1	IEA	ACCEPT
SCHPO/cut6	IBA	UNDECIDED
SCHPO/dfr1	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/erg8	IEA	UNDECIDED
SCHPO/fol3	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/gld1	IEA	ACCEPT
SCHPO/gpx1	IEA	ACCEPT
SCHPO/hal3	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
SCHPO/htd2	IBA	ACCEPT
SCHPO/htd2	IEA	ACCEPT
SCHPO/mct1	IBA	ACCEPT
SCHPO/mct1	IEA	ACCEPT
SCHPO/met9	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/nad1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/nad1	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/oar2	IEA	ACCEPT
SCHPO/oca8	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/pgk1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/pgk1	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/pgr1	IBA	ACCEPT
SCHPO/pgr1	IEA	ACCEPT
SCHPO/pmp20	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
SCHPO/rib2	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/rrg8	ISO	ACCEPT
SCHPO/sel0	IBA	ACCEPT
SCHPO/sel0	IEA	ACCEPT
SCHPO/sel0	ISS	ACCEPT
SCHPO/trr1	ISS	UNDECIDED
SCHPO/tsc13	ISO	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
TRYBB/TPR	IEA	UNDECIDED
human/ABCC9	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ABL1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ACACA	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/ACBD3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ADO	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ADO	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/AKAP10	IBA	ACCEPT
human/AKAP10	IEA	ACCEPT
human/ANK2	IEA	ACCEPT
human/ANK2	ISS	ACCEPT
human/ARAF	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ARAF	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ARL16	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ASAH2	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/ASB9	IEA	ACCEPT
human/ATP7B	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/AZIN2	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/BRAF	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/BRAF	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/C0HM83	IEA	ACCEPT
human/CALR	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/CAMK2A	ISS	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/CASP4	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CAVIN1	IEA	UNDECIDED
human/CCN6	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CFAP410	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CFAP91	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/CKB	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CKB	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/CKB	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/CRYAB	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CYP1B1	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CYP1B1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CYP1B1	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/DGAT2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/DGAT2	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/DHFR	IBA	ACCEPT
human/DHFR	IEA	ACCEPT
human/DHFR	ISS	ACCEPT
human/DTYMK	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ERCC6L2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ERN1	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/FADS1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/FADS1	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/FANCD2	ISO	NEW
human/FBXO7	IEA	ACCEPT
human/FKBP4	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/FMC1	IBA	ACCEPT
human/FMC1	IEA	ACCEPT
human/FOXO1	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/GATB	IBA	ACCEPT
human/GATB	IEA	ACCEPT
human/GATC	IBA	ACCEPT
human/GATC	IEA	ACCEPT
human/GLOD4	IEA	ACCEPT
human/GLUL	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/GLUL	ISS	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/GLYCTK	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/GTPBP3	IBA	ACCEPT
human/GTPBP3	IEA	ACCEPT
human/HLCS	IEA	ACCEPT
human/HSP90AA1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/IFIH1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/IFIT3	IEA	ACCEPT
human/IRF3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/KIF5B	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/KYNU	IBA	UNDECIDED
human/LDHA	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/MAP2K1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/MAP2K2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/MAPK1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/MAPK3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/MBTPS1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/MLDHR	IEA	ACCEPT
human/MT-RNR1__A0A0C5B5G6	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/MT-RNR2__Q8IVG9	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/MTO1	IBA	ACCEPT
human/MTO1	IEA	ACCEPT
human/MTO1	ISS	ACCEPT
human/MYL10	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/NENF	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/NLRP3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/PFDN2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/PFDN4	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/PNPO	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/PTS	IBA	UNDECIDED
human/PYCARD	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/PYCR2	IEA	ACCEPT
human/QRSL1	IBA	ACCEPT
human/QRSL1	IEA	ACCEPT
human/RFK	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/RGS2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/RRM2B	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/RSAD1	IEA	ACCEPT
human/RTL10	IBA	ACCEPT
human/RTL10	IEA	ACCEPT
human/SCP2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/SCP2	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/SECISBP2	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/SECISBP2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/SHMT1	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/SQSTM1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/STOM	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/STUB1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/STUB1	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/SYNE2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/TARDBP	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/TAX1BP1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/TICAM1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/TICAM1	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/TRAF3	IC	ACCEPT
human/TRAF3	IEA	ACCEPT
mouse/App	ISO	ACCEPT
mouse/Casp9	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Casp9	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Fkbp4	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Fkbp4	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Fkbp4	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Fyn	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Fyn	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Hsp90aa1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Hsp90aa1	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Hsp90aa1	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Map2k2	IEA	UNDECIDED
mouse/Mapk3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Myc	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
mouse/Pnkd	IBA	ACCEPT
mouse/Pnkd	IEA	ACCEPT
mouse/Pnkd	ISO	ACCEPT
mouse/Pnkd	ISS	ACCEPT
mouse/Uox	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Amacr	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Amacr	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Amacr	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Amacr	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Araf	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Araf	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Araf	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Casp9	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Casp9	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Gsta1	ISO	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
rat/Gsta2	ISO	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
rat/Gsta2	ISO	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
rat/Gsta4	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Hspa5	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Mapk1	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Mapk8	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Tardbp	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Tardbp	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
worm/J7SF87	IBA	ACCEPT
worm/J7SF87	IEA	ACCEPT
worm/ced-3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
worm/ced-4	IEA	ACCEPT
worm/glo-1	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
worm/pink-1	IBA	ACCEPT
worm/pink-1	IEA	ACCEPT
worm/skn-1	IEA	ACCEPT
worm/sqrd-1	IEA	ACCEPT
yeast/ACH1	IBA	ACCEPT
yeast/ACH1	IEA	ACCEPT
yeast/ACO2	IBA	ACCEPT
yeast/ACO2	IEA	ACCEPT
yeast/ACS1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/ADH4	IEA	ACCEPT
yeast/AHP1	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
yeast/ALD6	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
yeast/APN1	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/BIO2	IEA	ACCEPT
yeast/BIO3	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
yeast/BNA3	IBA	ACCEPT
yeast/BNA3	IEA	ACCEPT
yeast/CDC21	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
yeast/CEM1	IBA	ACCEPT
yeast/CEM1	IEA	ACCEPT
yeast/DFR1	IBA	ACCEPT
yeast/DUG1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/ECM31	IBA	ACCEPT
yeast/FAD1	IEA	ACCEPT
yeast/FAU1	IBA	ACCEPT
yeast/FAU1	IEA	ACCEPT
yeast/FOL3	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
yeast/GCV1	IBA	ACCEPT
yeast/GCV1	IEA	ACCEPT
yeast/GCV2	IBA	ACCEPT
yeast/GCV2	IEA	ACCEPT
yeast/GCV3	IBA	ACCEPT
yeast/GCV3	IEA	ACCEPT
yeast/GDB1	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
yeast/GLR1	IBA	ACCEPT
yeast/GLR1	IEA	ACCEPT
yeast/GPD2	IEA	ACCEPT
yeast/GRX2	IEA	ACCEPT
yeast/GUT1	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/HFA1	IBA	ACCEPT
yeast/HFA1	IEA	ACCEPT
yeast/HSC82	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
yeast/HTD2	IBA	ACCEPT
yeast/HTD2	IEA	ACCEPT
yeast/ILV1	IEA	ACCEPT
yeast/ILV2	IEA	ACCEPT
yeast/ILV3	IBA	ACCEPT
yeast/ILV3	IEA	ACCEPT
yeast/KGD4	IEA	ACCEPT
yeast/KGD4	RCA	ACCEPT
yeast/LEU4	IBA	ACCEPT
yeast/LEU4	IEA	ACCEPT
yeast/LEU9	IBA	ACCEPT
yeast/LEU9	IEA	ACCEPT
yeast/LSC2	IBA	ACCEPT
yeast/LSC2	IEA	ACCEPT
yeast/LSC2	RCA	ACCEPT
yeast/LYS12	IBA	ACCEPT
yeast/LYS12	IEA	ACCEPT
yeast/LYS21	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
yeast/LYS4	IEA	ACCEPT
yeast/MCT1	IBA	ACCEPT
yeast/MCT1	IEA	ACCEPT
yeast/MIS1	IBA	ACCEPT
yeast/MIS1	IEA	ACCEPT
yeast/OAR1	IEA	ACCEPT
yeast/PGK1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/RAD27	IEA	ACCEPT
yeast/SFA1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/SHM1	IBA	ACCEPT
yeast/SHM1	IEA	ACCEPT
yeast/TDH1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/TDH2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/TDH3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/TRR2	IEA	ACCEPT

mitochondrion (GO:0005739): with sub-compartment

gene	evidence	action	sub-compartments in review
9POAL/NCGR_LOCUS67308	IEA	ACCEPT	GO:0005743, GO:0005763
ARATH/ALDH12A1	IBA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/ALDH12A1	ISM	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/ARGAH1	IEA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/ARGAH1	ISM	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/ARGAH2	IEA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/ARGAH2	ISM	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/BGLU26	ISM	MODIFY	GO:0005741
ARATH/DELTA-OAT	IBA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/GDCH	IBA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/GDCH	IEA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/GDCH	ISM	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/GDCST	IBA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/GDCST	IEA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/GDCST	ISM	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/GLDP1	IBA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/GLDP1	IEA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/GLDP1	ISM	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/GLDP2	IBA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/GLDP2	IEA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/GLDP2	ISM	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/SHM1	IBA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/SHM1	IEA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/WHY2	IBA	ACCEPT	GO:0042645
ARATH/WHY2	IEA	ACCEPT	GO:0042645
ARATH/mtLPD1	IBA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/mtLPD1	ISM	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/mtLPD2	IBA	ACCEPT	GO:0005759
ARATH/mtLPD2	ISM	ACCEPT	GO:0005759
ASPFU/mcr1	IBA	ACCEPT	GO:0005741
CANAL/ALO1	IBA	ACCEPT	GO:0005741, GO:0031966, GO:0032473
CANAL/ALO1	IEA	ACCEPT	GO:0005741, GO:0031966, GO:0032473
CANAL/MCR1	IBA	ACCEPT	GO:0005741
CONPW/A0A5M3MRX5	IEA	ACCEPT	GO:0005759
DANRE/ak2	IBA	ACCEPT	GO:0005758
DANRE/coq8a	ISS	ACCEPT	GO:0031966
DANRE/cpt2	IBA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005743
DANRE/cpt2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005743
DANRE/cyp11a1.1	ISS	MODIFY	GO:0005743, GO:0031966
DROME/Acaa	IBA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005759
DROME/Acaa	ISM	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005759
DROME/Acadvl	ISS	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005743
DROME/Arc42	IBA	ACCEPT	GO:0005759
DROME/BNIP3	IEA	ACCEPT	GO:0005740, GO:0005741, GO:0031966
DROME/CG30022	IEA	MODIFY	GO:0005759
DROME/CG30022	ISS	MODIFY	GO:0005759
DROME/CG34117	IBA	ACCEPT	GO:0005759
DROME/CG4594	IBA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005759
DROME/CG4598	IBA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005759
DROME/Egm	IBA	ACCEPT	GO:0005759, GO:0160295
DROME/Egm	IEA	ACCEPT	GO:0005759, GO:0160295
DROME/GatA	IBA	ACCEPT	GO:0005759
DROME/GatA	IEA	ACCEPT	GO:0005759
DROME/GatC	IBA	ACCEPT	GO:0005759
DROME/GatC	IEA	ACCEPT	GO:0005759
DROME/GatC	ISS	ACCEPT	GO:0005759
DROME/HtrA2	IEA	ACCEPT	GO:0005758, GO:0031966
DROME/Idh	IBA	MODIFY	GO:0005759
DROME/Mcad	IBA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005759
DROME/Mcad	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005759
DROME/Men-b	IBA	MODIFY	GO:0005759
DROME/MetRS-m	IBA	ACCEPT	GO:0005759
DROME/MetRS-m	IEA	ACCEPT	GO:0005759
DROME/Mrm2	IBA	ACCEPT	GO:0005759
DROME/Mrm2	IEA	ACCEPT	GO:0005759
DROME/Mrm2	ISS	ACCEPT	GO:0005759
DROME/Mtpalpha	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005743, GO:0016507
DROME/Mtpalpha	ISM	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005743, GO:0016507
DROME/Mtpbeta	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005743, GO:0016507
DROME/Mtpbeta	ISM	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005743, GO:0016507
DROME/PNPase	IBA	ACCEPT	GO:0005759, GO:0045025
DROME/PolG1	IEA	ACCEPT	GO:0005759, GO:0005760, GO:0042645
DROME/PolG2	IEA	ACCEPT	GO:0005759, GO:0005760
DROME/Shmt	IBA	ACCEPT	GO:0005759
DROME/Sqor	IBA	MODIFY	GO:0005743
DROME/Sqor	IEA	MODIFY	GO:0005743
DROME/Suv3	IEA	ACCEPT	GO:0005759, GO:0045025
DROME/Tmlh	IBA	MODIFY	GO:0005759
DROME/mtDNA-helicase	IBA	ACCEPT	GO:0000262, GO:0005743, GO:0042645
DROME/mtDNA-helicase	IEA	ACCEPT	GO:0000262, GO:0005743, GO:0042645
DROME/mtSSB	IEA	ACCEPT	GO:0000262, GO:0042645
DROME/mtSSB	ISS	ACCEPT	GO:0000262, GO:0042645
DROME/scu	IBA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005759, GO:0030678
DROME/scu	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005759, GO:0030678
DROME/scu	ISS	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005759, GO:0030678
DROME/sea	IBA	ACCEPT	GO:0005743, GO:0031966
DROME/shop	IBA	MODIFY	GO:0005758
DROME/shop	IEA	MODIFY	GO:0005758
EMENI/mcr1	IBA	ACCEPT	GO:0005741
EQUAS/GPAT2__A0A8C4KXU5	IEA	MODIFY	GO:0005741, GO:0031966
EQUAS/NADK2	IEA	ACCEPT	GO:0005759
EQUAS/NADK2__A0A8C4M4D0	IEA	ACCEPT	GO:0005759
HORSE/ALDH7A1__A0A9L0R3Y5	IEA	ACCEPT	GO:0005759
HORSE/GPAM__A0A9L0TCA8	IBA	MODIFY	GO:0005741, GO:0031966
HORSE/GPAT2	IBA	MODIFY	GO:0005741
HORSE/GPAT2	IEA	MODIFY	GO:0005741
HORSE/HSPD1__A0A9L0S8L8	IEA	MODIFY	GO:0005743, GO:0005759
HORSE/NADK2	IBA	ACCEPT	GO:0005759
HORSE/NADK2	IEA	ACCEPT	GO:0005759
HORSE/SAT1	IEA	MODIFY	GO:0005743, GO:0031966, GO:0044284, GO:0061617
HORSE/SIRT5__A0A9L0T9B1	IBA	MODIFY	GO:0005759
HORSE/SIRT5__A0A9L0T9B1	IEA	MODIFY	GO:0005759
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endoplasmic reticulum (GO:0005783): with sub-compartment

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human/TXNDC12	IBA	ACCEPT	GO:0005788
human/TXNDC12	IEA	ACCEPT	GO:0005788
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rat/Cyb5r3	ISO	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005789
rat/Elovl7	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005789
rat/Elovl7	ISO	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005789
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rat/Hspa5	ISO	ACCEPT	GO:0005788, GO:0005789, GO:0005790, GO:0034663
rat/Hspa5	ISO	ACCEPT	GO:0005788, GO:0005789, GO:0005790, GO:0034663
rat/Itpr1	IEA	ACCEPT	GO:0005789, GO:0016529, GO:0030868
rat/Itpr1	ISO	ACCEPT	GO:0005789, GO:0016529, GO:0030868
rat/Itpr1	ISO	ACCEPT	GO:0005789, GO:0016529, GO:0030868
rat/Itpr3	IEA	ACCEPT	GO:0005789, GO:0016529, GO:0098554
rat/Sqle	IBA	ACCEPT	GO:0005789, GO:0098554
rat/Srebf1	ISO	ACCEPT	GO:0005789
rat/Uggt1	IBA	ACCEPT	GO:0005788
rat/Uggt1	ISO	ACCEPT	GO:0005788
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yeast/DFG10	IBA	ACCEPT	GO:0005789
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yeast/ELO1	IEA	ACCEPT	GO:0005789
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yeast/ELO3	IEA	ACCEPT	GO:0005789
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yeast/IFA38	IBA	ACCEPT	GO:0005789
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yeast/LCB2	IEA	ACCEPT	GO:0005789
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yeast/NSG1	IBA	ACCEPT	GO:0005789
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yeast/TSC13	IBA	ACCEPT	GO:0005789
yeast/VTC4	IBA	MODIFY	GO:0005789
yeast/YET2	IEA	ACCEPT	GO:0005789

Golgi apparatus (GO:0005794): root only

gene	evidence	action
DANRE/tomt	IEA	ACCEPT
DORPE/AP180	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
DROME/BicD	IBA	ACCEPT
DROME/CG3631	IEA	ACCEPT
DROME/Fer1HCH	IEA	ACCEPT
DROME/Fer2LCH	IEA	ACCEPT
DROME/NTPase	IEA	UNDECIDED
DROME/park	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
EQUAS/APP	IEA	ACCEPT
HORSE/APP	IBA	ACCEPT
HORSE/APP	IEA	ACCEPT
PANPA/A0A2R9CAF4	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
SCHPO/ayr1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/dca7	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/vps1302	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ABCA1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ACTL7A	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ACTL7A	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/ACTL7A	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/ADRB2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/AIMP1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ANGPTL3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/AP3B1	IEA	ACCEPT
human/AP3B2	IEA	ACCEPT
human/AP3S1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/AP3S2	IEA	ACCEPT
human/APC2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/APLP1	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/APLP1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ATP1A1	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/BICD2	IBA	ACCEPT
human/BICD2	IEA	ACCEPT
human/CABP2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CBL	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CD14	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CD247	IEA	UNDECIDED
human/CEP83	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CEPT1	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CERKL	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CHIC2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/CHRNA3	IEA	ACCEPT
human/CHRNA3	ISS	ACCEPT
human/CLU	ISS	ACCEPT
human/COQ6	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/CSNK1D	IEA	ACCEPT
human/CUL3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/DNM1L	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/DPAGT1	IEA	UNDECIDED
human/DRC4	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
human/DRC4	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/DYNC2LI1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/DYNLT1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/FBXW8	IEA	ACCEPT
human/FGD1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/FGD1	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/FGD4	ISS	UNDECIDED
human/FGF7	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/FGFR2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/GANAB	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/GANAB	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/GNAQ	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/GRB2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/GRB2	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/KIFAP3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/LDLR	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/LRP2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/LYN	IEA	ACCEPT
human/MAPK1	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/MAPK3	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/MS4A4A	IBA	ACCEPT
human/MYH9	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/NEDD9	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/NTN3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/P3H2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/PCSK9	IEA	ACCEPT
human/PICALM	IEA	ACCEPT
human/RP2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/RSAD2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/SELENOI	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/SFT2D3	ISS	NEW
human/SPG21	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/STC2	IEA	ACCEPT
human/SUN5	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/SUN5	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/SYN1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/SYNE1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/TBC1D14	IEA	ACCEPT
human/TCP1	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/TLR1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/TLR6	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/UBA5	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/VEGFA	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Agtr1a	IEA	UNDECIDED
mouse/Agtr1a	ISO	UNDECIDED
mouse/App	IBA	ACCEPT
mouse/App	IEA	ACCEPT
mouse/App	ISO	ACCEPT
mouse/Cbl	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Cbl	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Chrm2	ISO	UNDECIDED
mouse/Grb2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Map2k2	ISO	UNDECIDED
mouse/Mapk1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Mapk3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Pnkd	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
mouse/Slc5a1	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Actl7a	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Actl7a	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Actl7a	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Actl7a	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Aph1a	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Kdr	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Mapk1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Masp2	ISO	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
rat/Nedd4	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Pnkd__D3ZXB0	ISO	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
rat/Prkaa2	ISO	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
rat/Syt1	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
rat/Syt1	ISO	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
rat/Syt4	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Syt4	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Vegfa	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
worm/che-13	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
worm/pdr-1	IBA	UNDECIDED
worm/unc-11	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/GET3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/MNT4	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/MNT4	IEA	KEEP_AS_NON_CORE

Golgi apparatus (GO:0005794): with sub-compartment

gene	evidence	action	sub-compartments in review
ARATH/ABCG36	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005802
ARATH/CSLD3	ISM	MODIFY	GO:0000139, GO:0005802
ARATH/IRX10L	ISM	ACCEPT	GO:0000139, GO:0005797, GO:0005802
ARATH/MNS1	ISM	MODIFY	GO:0000137, GO:0000139, GO:0005802
ARATH/SYP121	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005802
BRADI/BRADI_1g66227v3	IEA	ACCEPT	GO:0032580
DANRE/glceb	IBA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0000139
DANRE/gnptab	IBA	ACCEPT	GO:0000139
DANRE/gnptab	ISS	ACCEPT	GO:0000139
DANRE/shha	ISS	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0000139
DROME/Arl1	IBA	ACCEPT	GO:0000139, GO:0005802
DROME/CG8841	ISS	MODIFY	GO:0000138, GO:0000139, GO:0005797
DROME/Sec71	IEA	ACCEPT	GO:0005802, GO:0032588
DROME/Vps52	IEA	MODIFY	GO:0000938, GO:0005802
DROME/Vps52	ISS	MODIFY	GO:0000938, GO:0005802
DROME/Vps53	IEA	MODIFY	GO:0000938, GO:0005802
DROME/Vps53	ISS	MODIFY	GO:0000938, GO:0005802
DROME/Zw10	IEA	ACCEPT	GO:0005795, GO:0036063
DROME/scat	IEA	MODIFY	GO:0000138, GO:0000938
DROME/scat	ISS	MODIFY	GO:0000138, GO:0000938
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human/CHSY1	IEA	ACCEPT	GO:0000139, GO:0032580
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human/CSGALNACT1	IEA	ACCEPT	GO:0000139, GO:0032580
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human/EXT1	IBA	MODIFY	GO:0000139
human/EXT1	IEA	MODIFY	GO:0000139
human/EXT2	IBA	MODIFY	GO:0000139
human/EXT2	IEA	MODIFY	GO:0000139
human/EXT2	ISS	MODIFY	GO:0000139
human/FAM20B	IEA	ACCEPT	GO:0000139
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human/GALNT3	IBA	ACCEPT	GO:0000139, GO:0032580
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human/GNPTAB	IBA	ACCEPT	GO:0000139
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human/LFNG	ISS	ACCEPT	GO:0000139
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human/LPCAT1	ISS	ACCEPT	GO:0000139
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human/LRRK2	ISS	ACCEPT	GO:0000139, GO:0005802
human/LYSET	IEA	ACCEPT	GO:0000139, GO:0031985
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human/MGAT1	IBA	ACCEPT	GO:0000139
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human/MMGT1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0000139
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human/RAB1B	IBA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0000139
human/RAB7B	IEA	ACCEPT	GO:0005802
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human/RAB8A	IEA	ACCEPT	GO:0000139, GO:0032588
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human/SGCE	ISS	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0000139
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human/SORL1	IEA	ACCEPT	GO:0000139, GO:0005802, GO:0031985
human/ST6GAL1	IBA	ACCEPT	GO:0000139, GO:0032580
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human/TMF1	IEA	ACCEPT	GO:0000139
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human/VTI1A	IEA	ACCEPT	GO:0000139, GO:0032588
human/ZDHHC23	IBA	MODIFY	GO:0000139
human/ZDHHC23	IEA	MODIFY	GO:0000139
mouse/Egfr	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0000139
mouse/Egfr	ISO	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0000139
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mouse/Hras	ISO	ACCEPT	GO:0000139
mouse/Hras	ISS	ACCEPT	GO:0000139
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mouse/Mtor	ISO	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0000139
mouse/Pld4	IEA	ACCEPT	GO:0032588
mouse/Zdhhc23	IBA	MODIFY	GO:0000139
mouse/Zdhhc23	IEA	MODIFY	GO:0000139
rat/Pik3c2a	IEA	ACCEPT	GO:0005802
worm/agef-1	IEA	ACCEPT	GO:0005802, GO:0032588
worm/gbf-1	IEA	ACCEPT	GO:0000137
worm/glo-1	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED	GO:0005802
worm/rab-11.1	IBA	ACCEPT	GO:0000139, GO:1990676
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yeast/APS1	ISS	ACCEPT	GO:0030121
yeast/MSC2	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED	GO:1990674
yeast/PIK1	IEA	ACCEPT	GO:0005802
yeast/PIS1	IBA	ACCEPT	GO:0000139
yeast/PTM1	IBA	ACCEPT	GO:0000139
yeast/VPS34	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0000139
yeast/VPS45	IEA	ACCEPT	GO:0000139
yeast/VPS74	IEA	ACCEPT	GO:0000139, GO:0005797, GO:0005802, GO:0032580

peroxisome (GO:0005777): root only

gene	evidence	action
ARATH/AGT1	IBA	ACCEPT
ARATH/AGT1	IEA	ACCEPT
ARATH/GGAT1	IEA	ACCEPT
ARATH/GGAT2	IEA	ACCEPT
ARATH/GGAT2	ISS	ACCEPT
ARATH/GLO1	IBA	ACCEPT
ARATH/GLO1	IEA	ACCEPT
ARATH/GLO2	IBA	ACCEPT
ARATH/GLO2	IEA	ACCEPT
ARATH/HPR	IEA	ACCEPT
DANRE/agxta	IBA	ACCEPT
DANRE/agxtb	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
DANRE/agxtb	ISS	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
DANRE/uox	IBA	ACCEPT
DANRE/uox	IEA	ACCEPT
DANRE/uox	ISS	ACCEPT
DANRE/urad	IBA	ACCEPT
DANRE/urad	IEA	ACCEPT
DROME/Acat1	ISM	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
DROME/Ech1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
DROME/Ech1	ISM	KEEP_AS_NON_CORE
DROME/Got1	ISM	UNDECIDED
DROME/Idh	ISS	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
DROME/Mdh1	ISM	UNDECIDED
DROME/Mtpalpha	ISM	KEEP_AS_NON_CORE
DROME/Mtpalpha	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
NICAT/NaMPO1_candidate_AMO_3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/SPCC1223.09	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/SPCC1223.09	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/cbl1	ISS	UNDECIDED
SCHPO/pik3	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/pmp20	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
SCHPO/pnc1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
SCHPO/pnc1	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
human/CD33	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/IDI1	IBA	ACCEPT
human/IDI1	IEA	ACCEPT
human/IDI1	ISS	ACCEPT
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human/IDI2	IEA	ACCEPT
human/MFF	IBA	ACCEPT
human/MFF	IEA	ACCEPT
human/PIK3C3	IBA	UNDECIDED
human/SOD1	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/SOD1	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/SOD1	ISS	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/TKT	ISS	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
human/XDH	IEA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
mouse/Uox	IBA	ACCEPT
mouse/Uox	IEA	ACCEPT
mouse/Uox	ISO	ACCEPT
rat/Acot1	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
rat/Amacr	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Amacr	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Amacr	ISO	KEEP_AS_NON_CORE
rat/Crot	IBA	ACCEPT
rat/Crot	IEA	ACCEPT
rat/Crot	ISO	ACCEPT
rat/Crot	ISO	ACCEPT
worm/mff-1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
worm/mff-2	IEA	ACCEPT
worm/vps-34	IBA	MARK_AS_OVER_ANNOTATED
yeast/AAT2	IEA	ACCEPT
yeast/AHP1	IBA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/CAT2	IBA	ACCEPT
yeast/CAT2	IEA	ACCEPT
yeast/CIT2	IEA	ACCEPT
yeast/DNM1	IBA	ACCEPT
yeast/DNM1	IEA	ACCEPT
yeast/FOX2	IBA	ACCEPT
yeast/FOX2	IEA	ACCEPT
yeast/GLR1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
yeast/GPD1	IEA	ACCEPT
yeast/PNC1	IEA	ACCEPT
yeast/VPS34	IBA	KEEP_AS_NON_CORE

peroxisome (GO:0005777): with sub-compartment

gene	evidence	action	sub-compartments in review
ARATH/BGLU26	IEA	ACCEPT	GO:0005778
ARATH/CAT2	IBA	MODIFY	GO:0005782
DROME/Dci	IEA	ACCEPT	GO:0005782
DROME/Dci	ISM	ACCEPT	GO:0005782
DROME/Dci	ISS	ACCEPT	GO:0005782
PENCH/aatA	IEA	ACCEPT	GO:0005782
PICAN/AMO	IEA	MODIFY	GO:0005782
SCHPO/cta1	IBA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005782
human/ABCD1	IEA	MODIFY	GO:0005778
human/ABCD3	IEA	ACCEPT	GO:0005778
human/ACAA1	IBA	ACCEPT	GO:0005782
human/ACAA1	IEA	ACCEPT	GO:0005782
human/ACOX1	IBA	ACCEPT	GO:0005782
human/ACOX1	IEA	ACCEPT	GO:0005782
human/ACOX2	IBA	ACCEPT	GO:0005782
human/ACOX2	IEA	ACCEPT	GO:0005782
human/ACOX2	ISS	ACCEPT	GO:0005782
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human/ACOX3	IEA	ACCEPT	GO:0005782
human/AGPS	IBA	ACCEPT	GO:0005778, GO:0005782
human/AGPS	IEA	ACCEPT	GO:0005778, GO:0005782
human/AGPS	ISS	ACCEPT	GO:0005778, GO:0005782
human/AGXT	IBA	ACCEPT	GO:0005782
human/AGXT	IEA	ACCEPT	GO:0005782
human/AMACR	IEA	ACCEPT	GO:0005782
human/BAAT	IBA	ACCEPT	GO:0005782
human/BAAT	IEA	ACCEPT	GO:0005782
human/BAAT	ISS	ACCEPT	GO:0005782
human/DNM1L	IEA	MODIFY	GO:0005778
human/EHHADH	IBA	ACCEPT	GO:0005782
human/EHHADH	IEA	ACCEPT	GO:0005782
human/EHHADH	ISS	ACCEPT	GO:0005782
human/FAR1	IEA	ACCEPT	GO:0005778
human/FAR2	IEA	ACCEPT	GO:0005778
human/FAR2	ISS	ACCEPT	GO:0005778
human/GNPAT	IEA	ACCEPT	GO:0005778, GO:0005782
human/HAO1	IEA	ACCEPT	GO:0005782
human/HMGCL	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005782
human/HMGCL	ISS	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005782
human/HSD17B4	IBA	ACCEPT	GO:0005778, GO:0005782
human/HSD17B4	IEA	ACCEPT	GO:0005778, GO:0005782
human/LONP2	IEA	ACCEPT	GO:0005782
human/PAOX	IEA	ACCEPT	GO:0005782
human/PEX1	IEA	ACCEPT	GO:0005778
human/PEX13	IEA	ACCEPT	GO:0005778
human/PEX14	IEA	ACCEPT	GO:0005778
human/PEX19	IEA	ACCEPT	GO:0005778
human/PEX19	ISS	ACCEPT	GO:0005778
human/PEX2	IEA	ACCEPT	GO:0005778
human/PEX26	IBA	ACCEPT	GO:0005778
human/SCP2	IBA	ACCEPT	GO:0005782
human/SCP2	IEA	ACCEPT	GO:0005782
human/SCP2	ISS	ACCEPT	GO:0005782
rat/Ddo	IEA	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005782
rat/Ddo	ISO	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005782
rat/Ddo	ISO	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005782
rat/Ddo	ISO	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005782
rat/Ddo	ISO	KEEP_AS_NON_CORE	GO:0005782
yeast/CTA1	IBA	ACCEPT	GO:0005782
yeast/DCI1	IEA	ACCEPT	GO:0005782
yeast/ECI1	IEA	ACCEPT	GO:0005782
yeast/FAT1	IBA	ACCEPT	GO:0005778
yeast/FAT1	IEA	ACCEPT	GO:0005778
yeast/IDP3	IBA	ACCEPT	GO:0005782
yeast/LYS1	IEA	ACCEPT	GO:0005782
yeast/MDH3	IEA	ACCEPT	GO:0005782
yeast/POT1	IBA	ACCEPT	GO:0005782
yeast/POT1	IEA	ACCEPT	GO:0005782
yeast/POX1	IBA	ACCEPT	GO:0005782
yeast/POX1	IEA	ACCEPT	GO:0005782
yeast/PXA1	IEA	ACCEPT	GO:0005778
yeast/PXA2	IEA	ACCEPT	GO:0005778
yeast/SPS19	IBA	ACCEPT	GO:0005782
yeast/SPS19	IEA	ACCEPT	GO:0005782

lysosome (GO:0005764): root only

gene	evidence	action
ANOGA/psidin	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
ANOGA/psidin	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
DANRE/tpp1	IBA	ACCEPT
DANRE/tpp1	IEA	ACCEPT
DANRE/tpp1	ISS	ACCEPT
HETGA/Has2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
HETGA/Has2	ISS	KEEP_AS_NON_CORE
HETGA/Hyal2	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ADA	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/ANK2	IEA	ACCEPT
human/ANK2	ISS	ACCEPT
human/ARRDC3	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/BACE1	IEA	ACCEPT
human/CRYAB	IEA	ACCEPT
human/CXCR4	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/GABARAP	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/IL4I1	IEA	ACCEPT
human/NBR1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/PLD4	IEA	ACCEPT
human/RAB7B	IBA	ACCEPT
human/RAB7B	IEA	ACCEPT
human/RAB8A	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
human/RAB9A	IBA	ACCEPT
human/RAB9B	IBA	ACCEPT
human/RTL9	ISS	NEW
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human/SOD1	IEA	KEEP_AS_NON_CORE
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